南通长城医院创办于1992年，其前身为中国人民解放军南通军分区医院，1998年更名为南通长城医院，是一所集医疗、教学、科研与康复为一体，以专科、专病、专治为特色的综合性医疗机构，是南通市政府首批对社会开放的医保定点医院。同时，也是上海市专家医学研究中心的临床科研基地和南通分部。

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